مستند «کاپیتان»، روایت نبرد با داعش از چشمان کاپیتان تانک  است.گروهی مستندساز راهی عراق شدند تا با یکی از گردان های حشدالشعبی به نام کتائب سیدالشهداء همراه باشند و روایتگر مجاهدت های بسیج مردمی عراق برای مقابله با تکفیری ها شوند.در این بین خدمه یکی از تانک های مستقر در گردان، توجه تیم سازنده را به خود جلب می کند و داستان از همینجا شروع می شود...